Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CNGA1P29973 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CNGA1P29973 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CNGA1P29973 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CNGA1P29973 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CNGA1P29973 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CNGA1P29973 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CNGA1P29973 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CNGA1P29973 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CNGA1P29973 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CNGA1P29973 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CNGA1P29973 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CNGA1P29973 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CNGA1P29973 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CNGA1P29973 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CNGA1P29973 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CNGA1P29973 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CNGA1P29973 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CNGA1P29973 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNGA1P29973 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNGA1P29973 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNGA1P29973 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNGA1P29973 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CNGA1P29973 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CNGA1P29973 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CNGA1P29973 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNGA1P29973 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNGA1P29973 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CNGA1P29973 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CNGA1P29973 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CNGA1P29973 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CNGA1P29973 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CNGA1P29973 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CNGA1P29973 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGA1P29973 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CNGA1P29973 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CNGA1P29973 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CNGA1P29973 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGA1P29973 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGA1P29973 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGA1P29973 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CNGA1P29973 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNGA1P29973 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CNGA1P29973 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGA1P29973 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGA1P29973 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CNGA1P29973 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CNGA1P29973 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CNGA1P29973 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNGA1P29973 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CNGA1P29973 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CNGA1P29973 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CNGA1P29973 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CNGA1P29973 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CNGA1P29973 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CNGA1P29973 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNGA1P29973 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNGA1P29973 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNGA1P29973 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNGA1P29973 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNGA1P29973 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNGA1P29973 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGA1P29973 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGA1P29973 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CNGA1P29973 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNGA1P29973 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CNGA1P29973 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGA1P29973 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CNGA1P29973 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGA1P29973 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGA1P29973 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CNGA1P29973 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CNGA1P29973 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNGA1P29973 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNGA1P29973 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CNGA1P29973 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CNGA1P29973 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CNGA1P29973 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CNGA1P29973 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CNGA1P29973 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CNGA1P29973 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CNGA1P29973 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CNGA1P29973 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGA1P29973 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNGA1P29973 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNGA1P29973 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CNGA1P29973 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNGA1P29973 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNGA1P29973 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CNGA1P29973 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CNGA1P29973 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNGA1P29973 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGA1P29973 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGA1P29973 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CNGA1P29973 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CNGA1P29973 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CNGA1P29973 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CNGA1P29973 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CNGA1P29973 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms