Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYN1P17600 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYN1P17600 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYN1P17600 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SYN1P17600 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYN1P17600 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYN1P17600 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYN1P17600 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYN1P17600 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYN1P17600 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYN1P17600 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYN1P17600 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SYN1P17600 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYN1P17600 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYN1P17600 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYN1P17600 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYN1P17600 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SYN1P17600 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYN1P17600 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYN1P17600 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYN1P17600 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYN1P17600 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYN1P17600 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYN1P17600 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYN1P17600 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYN1P17600 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYN1P17600 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SYN1P17600 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYN1P17600 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYN1P17600 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SYN1P17600 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYN1P17600 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYN1P17600 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYN1P17600 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYN1P17600 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SYN1P17600 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SYN1P17600 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYN1P17600 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYN1P17600 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYN1P17600 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYN1P17600 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYN1P17600 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYN1P17600 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYN1P17600 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYN1P17600 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYN1P17600 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYN1P17600 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYN1P17600 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYN1P17600 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYN1P17600 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYN1P17600 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYN1P17600 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYN1P17600 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYN1P17600 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYN1P17600 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYN1P17600 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYN1P17600 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYN1P17600 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYN1P17600 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYN1P17600 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SYN1P17600 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SYN1P17600 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYN1P17600 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYN1P17600 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYN1P17600 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYN1P17600 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYN1P17600 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYN1P17600 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYN1P17600 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYN1P17600 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYN1P17600 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYN1P17600 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYN1P17600 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYN1P17600 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYN1P17600 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SYN1P17600 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYN1P17600 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYN1P17600 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYN1P17600 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYN1P17600 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYN1P17600 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYN1P17600 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYN1P17600 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYN1P17600 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYN1P17600 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYN1P17600 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYN1P17600 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYN1P17600 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYN1P17600 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYN1P17600 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYN1P17600 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYN1P17600 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYN1P17600 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SYN1P17600 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYN1P17600 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYN1P17600 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYN1P17600 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYN1P17600 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYN1P17600 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYN1P17600 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms