Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GJB3O75712 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJB3O75712 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
GJB3O75712 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GJB3O75712 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GJB3O75712 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJB3O75712 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GJB3O75712 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GJB3O75712 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJB3O75712 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GJB3O75712 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GJB3O75712 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GJB3O75712 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJB3O75712 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJB3O75712 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJB3O75712 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJB3O75712 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJB3O75712 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJB3O75712 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJB3O75712 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJB3O75712 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJB3O75712 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJB3O75712 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJB3O75712 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
GJB3O75712 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GJB3O75712 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GJB3O75712 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GJB3O75712 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GJB3O75712 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB3O75712 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJB3O75712 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJB3O75712 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJB3O75712 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB3O75712 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB3O75712 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJB3O75712 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJB3O75712 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB3O75712 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJB3O75712 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJB3O75712 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB3O75712 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB3O75712 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB3O75712 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB3O75712 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB3O75712 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB3O75712 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJB3O75712 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB3O75712 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB3O75712 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB3O75712 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB3O75712 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB3O75712 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB3O75712 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJB3O75712 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJB3O75712 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB3O75712 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
GJB3O75712 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJB3O75712 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB3O75712 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJB3O75712 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJB3O75712 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJB3O75712 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJB3O75712 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJB3O75712 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB3O75712 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB3O75712 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB3O75712 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJB3O75712 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJB3O75712 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJB3O75712 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB3O75712 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB3O75712 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB3O75712 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJB3O75712 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB3O75712 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJB3O75712 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJB3O75712 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJB3O75712 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJB3O75712 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB3O75712 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB3O75712 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB3O75712 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB3O75712 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB3O75712 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB3O75712 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB3O75712 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB3O75712 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB3O75712 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB3O75712 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB3O75712 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB3O75712 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB3O75712 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB3O75712 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GJB3O75712 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB3O75712 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB3O75712 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB3O75712 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJB3O75712 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB3O75712 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB3O75712 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms