Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
COBLO75128 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
COBLO75128 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
COBLO75128 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
COBLO75128 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
COBLO75128 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
COBLO75128 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
COBLO75128 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
COBLO75128 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
COBLO75128 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
COBLO75128 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
COBLO75128 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
COBLO75128 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
COBLO75128 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
COBLO75128 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
COBLO75128 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
COBLO75128 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
COBLO75128 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
COBLO75128 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
COBLO75128 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
COBLO75128 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
COBLO75128 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
COBLO75128 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
COBLO75128 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
COBLO75128 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
COBLO75128 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
COBLO75128 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
COBLO75128 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
COBLO75128 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
COBLO75128 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
COBLO75128 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COBLO75128 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
COBLO75128 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
COBLO75128 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
COBLO75128 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COBLO75128 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
COBLO75128 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
COBLO75128 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
COBLO75128 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
COBLO75128 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
COBLO75128 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COBLO75128 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COBLO75128 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
COBLO75128 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
COBLO75128 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
COBLO75128 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COBLO75128 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
COBLO75128 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
COBLO75128 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
COBLO75128 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
COBLO75128 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COBLO75128 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COBLO75128 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COBLO75128 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COBLO75128 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COBLO75128 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
COBLO75128 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
COBLO75128 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
COBLO75128 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
COBLO75128 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COBLO75128 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COBLO75128 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COBLO75128 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COBLO75128 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
COBLO75128 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COBLO75128 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COBLO75128 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
COBLO75128 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COBLO75128 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COBLO75128 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COBLO75128 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
COBLO75128 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COBLO75128 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
COBLO75128 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
COBLO75128 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
COBLO75128 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COBLO75128 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COBLO75128 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COBLO75128 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COBLO75128 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COBLO75128 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
COBLO75128 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
COBLO75128 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COBLO75128 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COBLO75128 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
COBLO75128 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COBLO75128 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COBLO75128 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
COBLO75128 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COBLO75128 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COBLO75128 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COBLO75128 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
COBLO75128 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
COBLO75128 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COBLO75128 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COBLO75128 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COBLO75128 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
COBLO75128 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COBLO75128 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COBLO75128 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms