Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.52■■■■■ 5.2
BRD4O60885 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
BRD4O60885 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
BRD4O60885 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
BRD4O60885 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
BRD4O60885 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
BRD4O60885 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
BRD4O60885 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
BRD4O60885 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
BRD4O60885 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
BRD4O60885 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
BRD4O60885 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
BRD4O60885 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
BRD4O60885 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
BRD4O60885 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
BRD4O60885 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
BRD4O60885 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
BRD4O60885 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
BRD4O60885 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
BRD4O60885 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
BRD4O60885 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
BRD4O60885 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
BRD4O60885 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
BRD4O60885 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
BRD4O60885 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
BRD4O60885 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
BRD4O60885 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
BRD4O60885 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
BRD4O60885 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
BRD4O60885 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
BRD4O60885 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
BRD4O60885 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
BRD4O60885 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
BRD4O60885 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
BRD4O60885 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
BRD4O60885 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
BRD4O60885 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
BRD4O60885 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
BRD4O60885 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
BRD4O60885 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
BRD4O60885 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
BRD4O60885 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
BRD4O60885 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
BRD4O60885 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
BRD4O60885 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
BRD4O60885 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
BRD4O60885 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
BRD4O60885 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BRD4O60885 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BRD4O60885 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
BRD4O60885 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
BRD4O60885 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BRD4O60885 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
BRD4O60885 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
BRD4O60885 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BRD4O60885 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
BRD4O60885 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
BRD4O60885 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
BRD4O60885 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
BRD4O60885 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
BRD4O60885 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
BRD4O60885 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
BRD4O60885 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
BRD4O60885 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
BRD4O60885 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
BRD4O60885 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
BRD4O60885 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
BRD4O60885 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
BRD4O60885 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
BRD4O60885 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
BRD4O60885 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
BRD4O60885 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
BRD4O60885 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
BRD4O60885 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
BRD4O60885 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
BRD4O60885 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
BRD4O60885 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
BRD4O60885 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
BRD4O60885 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
BRD4O60885 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
BRD4O60885 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
BRD4O60885 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
BRD4O60885 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
BRD4O60885 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
BRD4O60885 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
BRD4O60885 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
BRD4O60885 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
BRD4O60885 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
BRD4O60885 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
BRD4O60885 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
BRD4O60885 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
BRD4O60885 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
BRD4O60885 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
BRD4O60885 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
BRD4O60885 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
BRD4O60885 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
BRD4O60885 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
BRD4O60885 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
BRD4O60885 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
BRD4O60885 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms