Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRDMT1O14717 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRDMT1O14717 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRDMT1O14717 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRDMT1O14717 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TRDMT1O14717 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRDMT1O14717 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRDMT1O14717 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TRDMT1O14717 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRDMT1O14717 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRDMT1O14717 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDMT1O14717 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRDMT1O14717 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRDMT1O14717 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRDMT1O14717 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRDMT1O14717 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRDMT1O14717 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRDMT1O14717 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRDMT1O14717 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRDMT1O14717 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
TRDMT1O14717 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRDMT1O14717 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRDMT1O14717 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRDMT1O14717 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRDMT1O14717 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRDMT1O14717 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRDMT1O14717 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1O14717 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1O14717 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRDMT1O14717 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRDMT1O14717 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRDMT1O14717 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRDMT1O14717 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRDMT1O14717 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRDMT1O14717 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRDMT1O14717 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRDMT1O14717 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRDMT1O14717 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRDMT1O14717 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRDMT1O14717 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRDMT1O14717 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRDMT1O14717 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TRDMT1O14717 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TRDMT1O14717 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRDMT1O14717 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRDMT1O14717 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRDMT1O14717 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRDMT1O14717 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDMT1O14717 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRDMT1O14717 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRDMT1O14717 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRDMT1O14717 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRDMT1O14717 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRDMT1O14717 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRDMT1O14717 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRDMT1O14717 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRDMT1O14717 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRDMT1O14717 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDMT1O14717 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRDMT1O14717 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRDMT1O14717 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRDMT1O14717 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRDMT1O14717 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRDMT1O14717 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TRDMT1O14717 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRDMT1O14717 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRDMT1O14717 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRDMT1O14717 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRDMT1O14717 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRDMT1O14717 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRDMT1O14717 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRDMT1O14717 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRDMT1O14717 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRDMT1O14717 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRDMT1O14717 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRDMT1O14717 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRDMT1O14717 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRDMT1O14717 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRDMT1O14717 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRDMT1O14717 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDMT1O14717 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDMT1O14717 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRDMT1O14717 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRDMT1O14717 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRDMT1O14717 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRDMT1O14717 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRDMT1O14717 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRDMT1O14717 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
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