Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms