Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.73■■■■■ 6.83
RIMBP3BA6NNM3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.28■■■■■ 6.76
RIMBP3BA6NNM3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.4■■■■■ 6.62
RIMBP3BA6NNM3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.9■■■■■ 6.54
RIMBP3BA6NNM3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.71■■■■■ 6.51
RIMBP3BA6NNM3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
RIMBP3BA6NNM3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
RIMBP3BA6NNM3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.09■■■■■ 6.41
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.02■■■■■ 6.4
RIMBP3BA6NNM3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.89■■■■■ 6.38
RIMBP3BA6NNM3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
RIMBP3BA6NNM3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.3
RIMBP3BA6NNM3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC54.33■■■■■ 6.29
RIMBP3BA6NNM3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
RIMBP3BA6NNM3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.99■■■■■ 6.23
RIMBP3BA6NNM3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
RIMBP3BA6NNM3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.56■■■■■ 6.16
RIMBP3BA6NNM3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.4■■■■■ 6.14
RIMBP3BA6NNM3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
RIMBP3BA6NNM3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
RIMBP3BA6NNM3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.27■■■■■ 6.12
RIMBP3BA6NNM3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.26■■■■■ 6.12
RIMBP3BA6NNM3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.19■■■■■ 6.11
RIMBP3BA6NNM3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
RIMBP3BA6NNM3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.08
RIMBP3BA6NNM3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
RIMBP3BA6NNM3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.91■■■■■ 6.06
RIMBP3BA6NNM3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.89■■■■■ 6.06
RIMBP3BA6NNM3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.8■■■■■ 6.04
RIMBP3BA6NNM3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.54■■■■■ 6
RIMBP3BA6NNM3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
RIMBP3BA6NNM3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.26■■■■■ 5.96
RIMBP3BA6NNM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.22■■■■■ 5.95
RIMBP3BA6NNM3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
RIMBP3BA6NNM3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.8■■■■■ 5.88
RIMBP3BA6NNM3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.69■■■■■ 5.86
RIMBP3BA6NNM3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
RIMBP3BA6NNM3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
RIMBP3BA6NNM3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
RIMBP3BA6NNM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.53■■■■■ 5.84
RIMBP3BA6NNM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
RIMBP3BA6NNM3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.38■■■■■ 5.82
RIMBP3BA6NNM3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.37■■■■■ 5.81
RIMBP3BA6NNM3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
RIMBP3BA6NNM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
RIMBP3BA6NNM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC51.23■■■■■ 5.79
RIMBP3BA6NNM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
RIMBP3BA6NNM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
RIMBP3BA6NNM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
RIMBP3BA6NNM3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.09■■■■■ 5.77
RIMBP3BA6NNM3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
RIMBP3BA6NNM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.87■■■■■ 5.73
RIMBP3BA6NNM3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.84■■■■■ 5.73
RIMBP3BA6NNM3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50.78■■■■■ 5.72
RIMBP3BA6NNM3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
RIMBP3BA6NNM3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
RIMBP3BA6NNM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
RIMBP3BA6NNM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
RIMBP3BA6NNM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
RIMBP3BA6NNM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
RIMBP3BA6NNM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
RIMBP3BA6NNM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
RIMBP3BA6NNM3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
RIMBP3BA6NNM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
RIMBP3BA6NNM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
RIMBP3BA6NNM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
RIMBP3BA6NNM3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.24■■■■■ 5.63
RIMBP3BA6NNM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.24■■■■■ 5.63
RIMBP3BA6NNM3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
RIMBP3BA6NNM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
RIMBP3BA6NNM3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
RIMBP3BA6NNM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.12■■■■■ 5.61
RIMBP3BA6NNM3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
RIMBP3BA6NNM3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.08■■■■■ 5.61
RIMBP3BA6NNM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
RIMBP3BA6NNM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
RIMBP3BA6NNM3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
RIMBP3BA6NNM3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
RIMBP3BA6NNM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
RIMBP3BA6NNM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
RIMBP3BA6NNM3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
RIMBP3BA6NNM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
RIMBP3BA6NNM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.87■■■■■ 5.57
RIMBP3BA6NNM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
RIMBP3BA6NNM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
RIMBP3BA6NNM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
RIMBP3BA6NNM3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
RIMBP3BA6NNM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.73■■■■■ 5.55
RIMBP3BA6NNM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.73■■■■■ 5.55
RIMBP3BA6NNM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
RIMBP3BA6NNM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
RIMBP3BA6NNM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
RIMBP3BA6NNM3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
RIMBP3BA6NNM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
RIMBP3BA6NNM3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
RIMBP3BA6NNM3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
RIMBP3BA6NNM3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
RIMBP3BA6NNM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC49.38■■■■■ 5.49
RIMBP3BA6NNM3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
RIMBP3BA6NNM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms