Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms