Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SORCS2Q96PQ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms