Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNXAQ16473 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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