Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNXAQ16473 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNXAQ16473 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNXAQ16473 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNXAQ16473 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNXAQ16473 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNXAQ16473 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNXAQ16473 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNXAQ16473 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNXAQ16473 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNXAQ16473 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNXAQ16473 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNXAQ16473 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNXAQ16473 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNXAQ16473 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNXAQ16473 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNXAQ16473 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNXAQ16473 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNXAQ16473 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNXAQ16473 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNXAQ16473 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNXAQ16473 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNXAQ16473 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNXAQ16473 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNXAQ16473 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNXAQ16473 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNXAQ16473 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNXAQ16473 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNXAQ16473 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNXAQ16473 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNXAQ16473 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNXAQ16473 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNXAQ16473 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNXAQ16473 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNXAQ16473 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNXAQ16473 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNXAQ16473 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNXAQ16473 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNXAQ16473 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNXAQ16473 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNXAQ16473 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNXAQ16473 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNXAQ16473 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNXAQ16473 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNXAQ16473 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNXAQ16473 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNXAQ16473 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNXAQ16473 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNXAQ16473 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNXAQ16473 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNXAQ16473 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNXAQ16473 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNXAQ16473 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNXAQ16473 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNXAQ16473 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNXAQ16473 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNXAQ16473 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNXAQ16473 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNXAQ16473 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNXAQ16473 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNXAQ16473 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNXAQ16473 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNXAQ16473 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNXAQ16473 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNXAQ16473 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNXAQ16473 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNXAQ16473 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNXAQ16473 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNXAQ16473 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNXAQ16473 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNXAQ16473 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNXAQ16473 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNXAQ16473 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNXAQ16473 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNXAQ16473 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNXAQ16473 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNXAQ16473 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNXAQ16473 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNXAQ16473 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNXAQ16473 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNXAQ16473 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNXAQ16473 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNXAQ16473 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNXAQ16473 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNXAQ16473 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNXAQ16473 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNXAQ16473 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNXAQ16473 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNXAQ16473 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNXAQ16473 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNXAQ16473 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNXAQ16473 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNXAQ16473 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNXAQ16473 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNXAQ16473 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
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