Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SIRT2-213ENST00000462654 2539 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.513e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 SIRT2-215ENST00000479290 4734 ntTSL 217.32■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.251e-9■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.221e-9■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.031e-9■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFA9-206ENST00000540688 642 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.295e-11■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC005833.3-201ENST00000543979 864 ntTSL 211.78□□□□□ -0.525e-11■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.925e-11■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.985e-11■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-19■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 TMEM219-209ENST00000602948 588 ntTSL 221.83■■□□□ 1.092e-15■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.92e-12■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-12■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-219ENST00000636942 1696 ntTSL 524.71■■□□□ 1.553e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-225ENST00000637563 2622 ntTSL 520.36■□□□□ 0.853e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 519.93■□□□□ 0.783e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ABHD14A-ACY1-206ENST00000635937 3078 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.184e-27■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.054e-27■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.464e-27■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)31.73■■■□□ 2.674e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 STX10-205ENST00000587318 704 ntTSL 216.55■□□□□ 0.244e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC090004.1-202ENST00000601399 787 ntTSL 513.28□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC090004.1-203ENST00000626721 886 ntTSL 510.78□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 PAM16-203ENST00000571819 317 ntTSL 518.09■□□□□ 0.499e-10■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 215.49■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 215.19■□□□□ 0.021e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-233ENST00000482563 1737 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-230ENST00000476806 754 ntTSL 58.82□□□□□ -11e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 27.16□□□□□ -1.261e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-241ENST00000496183 632 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-240ENST00000495293 759 ntTSL 25.28□□□□□ -1.561e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RBM39-235ENST00000490354 436 ntTSL 25.08□□□□□ -1.61e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 PCYT2-217ENST00000574343 693 ntTSL 220.2■□□□□ 0.822e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 PCYT2-212ENST00000572995 804 ntTSL 318.54■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.817e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.577e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.487e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFB2-211ENST00000476181 660 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.797e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.097e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)28.76■■■□□ 2.195e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 228.32■■■□□ 2.125e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.035e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.815e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 225.88■■□□□ 1.735e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.819e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.639e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HSF1-202ENST00000527328 2336 ntTSL 218.54■□□□□ 0.569e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HSF1-210ENST00000532338 3451 ntTSL 214.61□□□□□ -0.079e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP2A-205ENST00000600006 766 ntTSL 29.58□□□□□ -0.881e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-26■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GGA2-208ENST00000566685 571 ntTSL 419.62■□□□□ 0.732e-26■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-26■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 311.67□□□□□ -0.542e-26■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-26■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 325.05■■□□□ 1.61e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 521.93■■□□□ 1.11e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 POLD2-213ENST00000470867 678 ntTSL 520.31■□□□□ 0.841e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 POLD2-217ENST00000496539 571 ntTSL 219.59■□□□□ 0.731e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP7-203ENST00000517325 2639 ntTSL 218.48■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 POLD2-203ENST00000418438 556 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP7-210ENST00000523091 2672 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.952e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 AP000902.1-201ENST00000578806 368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.182e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.989e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 BAG1-207ENST00000473781 681 ntTSL 317.75■□□□□ 0.438e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.018e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HIPK1-202ENST00000361587 5766 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.568e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.058e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 BAG1-206ENST00000473464 551 ntTSL 58.44□□□□□ -1.068e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.068e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.12e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.216e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.366e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.166e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.076e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.376e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-224ENST00000613154 1863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.586e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-203ENST00000337898 1465 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.656e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.026e-7■■■□□ 18.7
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