RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496539.1

POLD2-217, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, humanhuman

TSL 2

Gene POLD2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2-217ENST00000496539 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.71■■■■■ 4.11
POLD2-217ENST00000496539 ABCC9O60706 1549 aa37.03■■■■□ 3.52
POLD2-217ENST00000496539 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.72■■■■□ 3.47
POLD2-217ENST00000496539 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.05■■■■□ 3.2
POLD2-217ENST00000496539 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.03■■■■□ 3.2
POLD2-217ENST00000496539 NACADO15069 1562 aa34.7■■■■□ 3.14
POLD2-217ENST00000496539 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.53■■■■□ 3.12
POLD2-217ENST00000496539 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.37■■■■□ 3.09
POLD2-217ENST00000496539 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
POLD2-217ENST00000496539 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.19■■■■□ 3.06
POLD2-217ENST00000496539 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.07■■■■□ 3.04
POLD2-217ENST00000496539 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
POLD2-217ENST00000496539 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.55■■■□□ 2.96
POLD2-217ENST00000496539 SCRIBQ14160 1630 aa33.5■■■□□ 2.95
POLD2-217ENST00000496539 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.47■■■□□ 2.95
POLD2-217ENST00000496539 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.44■■■□□ 2.94
POLD2-217ENST00000496539 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.32■■■□□ 2.92
POLD2-217ENST00000496539 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
POLD2-217ENST00000496539 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.26■■■□□ 2.75
POLD2-217ENST00000496539 NCAPD3P42695 1498 aa32.02■■■□□ 2.72
POLD2-217ENST00000496539 CUX2O14529 1486 aa31.93■■■□□ 2.7
POLD2-217ENST00000496539 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.93■■■□□ 2.7
POLD2-217ENST00000496539 SMARCA4P51532 1647 aa31.89■■■□□ 2.7
POLD2-217ENST00000496539 ERCC6Q03468 1493 aa31.88■■■□□ 2.69
POLD2-217ENST00000496539 HMGXB3Q12766 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
POLD2-217ENST00000496539 NESP48681 1621 aa31.78■■■□□ 2.68
POLD2-217ENST00000496539 SMARCA2P51531 1590 aa31.77■■■□□ 2.68
POLD2-217ENST00000496539 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
POLD2-217ENST00000496539 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
POLD2-217ENST00000496539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
POLD2-217ENST00000496539 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.54■■■□□ 2.64
POLD2-217ENST00000496539 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.43■■■□□ 2.62
POLD2-217ENST00000496539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.43■■■□□ 2.62
POLD2-217ENST00000496539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
POLD2-217ENST00000496539 WIZO95785 1651 aa31.1■■■□□ 2.57
POLD2-217ENST00000496539 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.1■■■□□ 2.57
POLD2-217ENST00000496539 CADPSQ9ULU8 1353 aa31■■■□□ 2.55
POLD2-217ENST00000496539 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.95■■■□□ 2.55
POLD2-217ENST00000496539 WDR62O43379 1518 aa30.95■■■□□ 2.55
POLD2-217ENST00000496539 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.76■■■□□ 2.52
POLD2-217ENST00000496539 TRIM41Q8WV44 630 aa30.75■■■□□ 2.51
POLD2-217ENST00000496539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.71■■■□□ 2.51
POLD2-217ENST00000496539 CFTRP13569 1480 aa30.63■■■□□ 2.49
POLD2-217ENST00000496539 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
POLD2-217ENST00000496539 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.49
POLD2-217ENST00000496539 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
POLD2-217ENST00000496539 PRDM2Q13029 1718 aa30.49■■■□□ 2.47
POLD2-217ENST00000496539 OSCARQ8IYS5 282 aa30.32■■■□□ 2.44
POLD2-217ENST00000496539 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
POLD2-217ENST00000496539 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.23■■■□□ 2.43
POLD2-217ENST00000496539 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
POLD2-217ENST00000496539 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
POLD2-217ENST00000496539 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
POLD2-217ENST00000496539 TOPBP1Q92547 1522 aa30.14■■■□□ 2.42
POLD2-217ENST00000496539 IFT140Q96RY7 1462 aa30.12■■■□□ 2.41
POLD2-217ENST00000496539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
POLD2-217ENST00000496539 ARHGEF11O15085 1522 aa30.03■■■□□ 2.4
POLD2-217ENST00000496539 CHD1O14646 1710 aa30■■■□□ 2.39
POLD2-217ENST00000496539 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.99■■■□□ 2.39
POLD2-217ENST00000496539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
POLD2-217ENST00000496539 ABCC8Q09428 1581 aa29.89■■■□□ 2.38
POLD2-217ENST00000496539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.371e-6■■■■■ 29.6
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POLD2-217ENST00000496539 ARAP1Q96P48 1450 aa29.74■■■□□ 2.35
POLD2-217ENST00000496539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.74■■■□□ 2.35
POLD2-217ENST00000496539 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.71■■■□□ 2.35
POLD2-217ENST00000496539 FBLN2P98095 1184 aa29.62■■■□□ 2.33
POLD2-217ENST00000496539 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
POLD2-217ENST00000496539 SOGA1O94964 1423 aa29.58■■■□□ 2.33
POLD2-217ENST00000496539 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.58■■■□□ 2.33
POLD2-217ENST00000496539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.57■■■□□ 2.32
POLD2-217ENST00000496539 CUX1P39880 1505 aa29.55■■■□□ 2.32
POLD2-217ENST00000496539 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.55■■■□□ 2.32
POLD2-217ENST00000496539 WDR97A6NE52 1622 aa29.52■■■□□ 2.32
POLD2-217ENST00000496539 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
POLD2-217ENST00000496539 PBRM1Q86U86 1689 aa29.43■■■□□ 2.3
POLD2-217ENST00000496539 SYNJ1O43426 1573 aa29.4■■■□□ 2.3
POLD2-217ENST00000496539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
POLD2-217ENST00000496539 GRIN2BQ13224 1484 aa29.36■■■□□ 2.29
POLD2-217ENST00000496539 SYNJ2O15056 1496 aa29.32■■■□□ 2.28
POLD2-217ENST00000496539 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
POLD2-217ENST00000496539 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.28■■■□□ 2.28
POLD2-217ENST00000496539 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.24■■■□□ 2.27
POLD2-217ENST00000496539 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.19■■■□□ 2.26
POLD2-217ENST00000496539 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.16■■■□□ 2.26
POLD2-217ENST00000496539 ADAMTS12P58397 1594 aa29.07■■■□□ 2.24
POLD2-217ENST00000496539 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
POLD2-217ENST00000496539 GRIN2AQ12879 1464 aa29.04■■■□□ 2.24
POLD2-217ENST00000496539 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.02■■■□□ 2.24
POLD2-217ENST00000496539 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.23
POLD2-217ENST00000496539 TOP2BQ02880 1626 aa28.95■■■□□ 2.23
POLD2-217ENST00000496539 SHROOM2Q13796 1616 aa28.95■■■□□ 2.23
POLD2-217ENST00000496539 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
POLD2-217ENST00000496539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
POLD2-217ENST00000496539 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.84■■■□□ 2.21
POLD2-217ENST00000496539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.82■■■□□ 2.2
POLD2-217ENST00000496539 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.79■■■□□ 2.2
POLD2-217ENST00000496539 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
POLD2-217ENST00000496539 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
POLD2-217ENST00000496539 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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