Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf16Q9BUW7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms