RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276616.2

PSKH2-201, Transcript of protein serine kinase H2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSKH2, Length 1,322 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSKH2-201ENST00000276616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.56■■■■■ 5.2
PSKH2-201ENST00000276616 ABCC9O60706 1549 aa43.05■■■■■ 4.48
PSKH2-201ENST00000276616 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.75■■■■■ 4.43
PSKH2-201ENST00000276616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
PSKH2-201ENST00000276616 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.67■■■■■ 4.1
PSKH2-201ENST00000276616 NACADO15069 1562 aa40.43■■■■■ 4.06
PSKH2-201ENST00000276616 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.27■■■■■ 4.04
PSKH2-201ENST00000276616 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.09■■■■■ 4.01
PSKH2-201ENST00000276616 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.07■■■■■ 4
PSKH2-201ENST00000276616 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
PSKH2-201ENST00000276616 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.73■■■■□ 3.95
PSKH2-201ENST00000276616 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
PSKH2-201ENST00000276616 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.19■■■■□ 3.86
PSKH2-201ENST00000276616 SCRIBQ14160 1630 aa39.03■■■■□ 3.84
PSKH2-201ENST00000276616 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
PSKH2-201ENST00000276616 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.88■■■■□ 3.81
PSKH2-201ENST00000276616 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.74■■■■□ 3.79
PSKH2-201ENST00000276616 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
PSKH2-201ENST00000276616 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.36■■■■□ 3.57
PSKH2-201ENST00000276616 NCAPD3P42695 1498 aa37.34■■■■□ 3.57
PSKH2-201ENST00000276616 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.25■■■■□ 3.55
PSKH2-201ENST00000276616 SMARCA4P51532 1647 aa37.18■■■■□ 3.54
PSKH2-201ENST00000276616 ERCC6Q03468 1493 aa37.09■■■■□ 3.53
PSKH2-201ENST00000276616 SMARCA2P51531 1590 aa37.06■■■■□ 3.52
PSKH2-201ENST00000276616 CUX2O14529 1486 aa37.06■■■■□ 3.52
PSKH2-201ENST00000276616 HMGXB3Q12766 1538 aa37.04■■■■□ 3.52
PSKH2-201ENST00000276616 NESP48681 1621 aa36.97■■■■□ 3.51
PSKH2-201ENST00000276616 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
PSKH2-201ENST00000276616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
PSKH2-201ENST00000276616 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.77■■■■□ 3.48
PSKH2-201ENST00000276616 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.71■■■■□ 3.47
PSKH2-201ENST00000276616 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PSKH2-201ENST00000276616 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.53■■■■□ 3.44
PSKH2-201ENST00000276616 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.5■■■■□ 3.43
PSKH2-201ENST00000276616 WIZO95785 1651 aa36.31■■■■□ 3.4
PSKH2-201ENST00000276616 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.28■■■■□ 3.4
PSKH2-201ENST00000276616 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.2■■■■□ 3.39
PSKH2-201ENST00000276616 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.04■■■■□ 3.36
PSKH2-201ENST00000276616 WDR62O43379 1518 aa35.99■■■■□ 3.35
PSKH2-201ENST00000276616 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.85■■■■□ 3.33
PSKH2-201ENST00000276616 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PSKH2-201ENST00000276616 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.82■■■■□ 3.32
PSKH2-201ENST00000276616 CFTRP13569 1480 aa35.76■■■■□ 3.31
PSKH2-201ENST00000276616 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
PSKH2-201ENST00000276616 TRIM41Q8WV44 630 aa35.68■■■■□ 3.3
PSKH2-201ENST00000276616 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
PSKH2-201ENST00000276616 PRDM2Q13029 1718 aa35.48■■■■□ 3.27
PSKH2-201ENST00000276616 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.36■■■■□ 3.25
PSKH2-201ENST00000276616 OSCARQ8IYS5 282 aa35.34■■■■□ 3.25
PSKH2-201ENST00000276616 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PSKH2-201ENST00000276616 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PSKH2-201ENST00000276616 TOPBP1Q92547 1522 aa35.14■■■■□ 3.22
PSKH2-201ENST00000276616 IFT140Q96RY7 1462 aa35.12■■■■□ 3.21
PSKH2-201ENST00000276616 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
PSKH2-201ENST00000276616 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
PSKH2-201ENST00000276616 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
PSKH2-201ENST00000276616 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
PSKH2-201ENST00000276616 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.97■■■■□ 3.19
PSKH2-201ENST00000276616 ABCC8Q09428 1581 aa34.91■■■■□ 3.18
PSKH2-201ENST00000276616 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
PSKH2-201ENST00000276616 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
PSKH2-201ENST00000276616 ARHGEF11O15085 1522 aa34.85■■■■□ 3.17
PSKH2-201ENST00000276616 CHD1O14646 1710 aa34.83■■■■□ 3.17
PSKH2-201ENST00000276616 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
PSKH2-201ENST00000276616 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.7■■■■□ 3.15
PSKH2-201ENST00000276616 FBLN2P98095 1184 aa34.62■■■■□ 3.13
PSKH2-201ENST00000276616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.62■■■■□ 3.13
PSKH2-201ENST00000276616 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PSKH2-201ENST00000276616 SOGA1O94964 1423 aa34.58■■■■□ 3.13
PSKH2-201ENST00000276616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
PSKH2-201ENST00000276616 ARAP1Q96P48 1450 aa34.52■■■■□ 3.12
PSKH2-201ENST00000276616 CUX1P39880 1505 aa34.5■■■■□ 3.11
PSKH2-201ENST00000276616 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.45■■■■□ 3.11
PSKH2-201ENST00000276616 WDR97A6NE52 1622 aa34.35■■■■□ 3.09
PSKH2-201ENST00000276616 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.34■■■■□ 3.09
PSKH2-201ENST00000276616 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PSKH2-201ENST00000276616 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PSKH2-201ENST00000276616 GRIN2BQ13224 1484 aa34.27■■■■□ 3.08
PSKH2-201ENST00000276616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
PSKH2-201ENST00000276616 PBRM1Q86U86 1689 aa34.24■■■■□ 3.07
PSKH2-201ENST00000276616 SYNJ1O43426 1573 aa34.23■■■■□ 3.07
PSKH2-201ENST00000276616 SYNJ2O15056 1496 aa34.19■■■■□ 3.06
PSKH2-201ENST00000276616 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.15■■■■□ 3.06
PSKH2-201ENST00000276616 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.1■■■■□ 3.05
PSKH2-201ENST00000276616 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.08■■■■□ 3.05
PSKH2-201ENST00000276616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.9■■■■□ 3.02
PSKH2-201ENST00000276616 GRIN2AQ12879 1464 aa33.86■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.86■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 ADAMTS12P58397 1594 aa33.85■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 TOP2BQ02880 1626 aa33.84■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 CEP170Q5SW79 1584 aa33.82■■■■□ 3.01
PSKH2-201ENST00000276616 NUP160Q12769 1436 aa33.75■■■□□ 2.99
PSKH2-201ENST00000276616 SHROOM2Q13796 1616 aa33.67■■■□□ 2.98
PSKH2-201ENST00000276616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.67■■■□□ 2.98
PSKH2-201ENST00000276616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.62■■■□□ 2.97
PSKH2-201ENST00000276616 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.53■■■□□ 2.96
PSKH2-201ENST00000276616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
PSKH2-201ENST00000276616 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.44■■■□□ 2.94
PSKH2-201ENST00000276616 JPH4Q96JJ6 628 aa33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms