Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NANOGP8Q6NSW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms