RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374593.4

CTNNAL1-202, Transcript of catenin alpha like 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTNNAL1, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1-202ENST00000374593 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.62■■■■■ 6.17
CTNNAL1-202ENST00000374593 ABCC9O60706 1549 aa48.18■■■■■ 5.3
CTNNAL1-202ENST00000374593 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.11■■■■■ 5.29
CTNNAL1-202ENST00000374593 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.81■■■■■ 4.92
CTNNAL1-202ENST00000374593 NACADO15069 1562 aa45.5■■■■■ 4.87
CTNNAL1-202ENST00000374593 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.28■■■■■ 4.84
CTNNAL1-202ENST00000374593 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.19■■■■■ 4.82
CTNNAL1-202ENST00000374593 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.87■■■■■ 4.77
CTNNAL1-202ENST00000374593 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.84■■■■■ 4.77
CTNNAL1-202ENST00000374593 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.81■■■■■ 4.76
CTNNAL1-202ENST00000374593 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.55■■■■■ 4.72
CTNNAL1-202ENST00000374593 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
CTNNAL1-202ENST00000374593 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.29■■■■■ 4.68
CTNNAL1-202ENST00000374593 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
CTNNAL1-202ENST00000374593 SCRIBQ14160 1630 aa43.85■■■■■ 4.61
CTNNAL1-202ENST00000374593 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.52■■■■■ 4.56
CTNNAL1-202ENST00000374593 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
CTNNAL1-202ENST00000374593 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.4■■■■■ 4.54
CTNNAL1-202ENST00000374593 NCAPD3P42695 1498 aa42.03■■■■■ 4.32
CTNNAL1-202ENST00000374593 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.9■■■■■ 4.3
CTNNAL1-202ENST00000374593 SMARCA4P51532 1647 aa41.84■■■■■ 4.29
CTNNAL1-202ENST00000374593 SMARCA2P51531 1590 aa41.75■■■■■ 4.27
CTNNAL1-202ENST00000374593 HMGXB3Q12766 1538 aa41.7■■■■■ 4.27
CTNNAL1-202ENST00000374593 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
CTNNAL1-202ENST00000374593 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.57■■■■■ 4.25
CTNNAL1-202ENST00000374593 ERCC6Q03468 1493 aa41.56■■■■■ 4.24
CTNNAL1-202ENST00000374593 CUX2O14529 1486 aa41.53■■■■■ 4.24
CTNNAL1-202ENST00000374593 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CTNNAL1-202ENST00000374593 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.44■■■■■ 4.22
CTNNAL1-202ENST00000374593 NESP48681 1621 aa41.4■■■■■ 4.22
CTNNAL1-202ENST00000374593 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.33■■■■■ 4.21
CTNNAL1-202ENST00000374593 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.07■■■■■ 4.16
CTNNAL1-202ENST00000374593 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CTNNAL1-202ENST00000374593 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.84■■■■■ 4.13
CTNNAL1-202ENST00000374593 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.82■■■■■ 4.12
CTNNAL1-202ENST00000374593 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.12
CTNNAL1-202ENST00000374593 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.73■■■■■ 4.11
CTNNAL1-202ENST00000374593 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.49■■■■■ 4.07
CTNNAL1-202ENST00000374593 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CTNNAL1-202ENST00000374593 WDR62O43379 1518 aa40.41■■■■■ 4.06
CTNNAL1-202ENST00000374593 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.32■■■■■ 4.04
CTNNAL1-202ENST00000374593 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CTNNAL1-202ENST00000374593 CFTRP13569 1480 aa40.27■■■■■ 4.04
CTNNAL1-202ENST00000374593 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.27■■■■■ 4.04
CTNNAL1-202ENST00000374593 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
CTNNAL1-202ENST00000374593 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.84■■■■□ 3.97
CTNNAL1-202ENST00000374593 PRDM2Q13029 1718 aa39.83■■■■□ 3.97
CTNNAL1-202ENST00000374593 TRIM41Q8WV44 630 aa39.7■■■■□ 3.95
CTNNAL1-202ENST00000374593 OSCARQ8IYS5 282 aa39.59■■■■□ 3.93
CTNNAL1-202ENST00000374593 TOPBP1Q92547 1522 aa39.51■■■■□ 3.92
CTNNAL1-202ENST00000374593 IFT140Q96RY7 1462 aa39.5■■■■□ 3.91
CTNNAL1-202ENST00000374593 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
CTNNAL1-202ENST00000374593 ABCC8Q09428 1581 aa39.38■■■■□ 3.9
CTNNAL1-202ENST00000374593 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.36■■■■□ 3.89
CTNNAL1-202ENST00000374593 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CTNNAL1-202ENST00000374593 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
CTNNAL1-202ENST00000374593 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CTNNAL1-202ENST00000374593 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CTNNAL1-202ENST00000374593 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.13■■■■□ 3.85
CTNNAL1-202ENST00000374593 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
CTNNAL1-202ENST00000374593 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.85
CTNNAL1-202ENST00000374593 ARHGEF11O15085 1522 aa39.01■■■■□ 3.84
CTNNAL1-202ENST00000374593 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.97■■■■□ 3.83
CTNNAL1-202ENST00000374593 CHD1O14646 1710 aa38.95■■■■□ 3.83
CTNNAL1-202ENST00000374593 SOGA1O94964 1423 aa38.9■■■■□ 3.82
CTNNAL1-202ENST00000374593 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.86■■■■□ 3.81
CTNNAL1-202ENST00000374593 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CTNNAL1-202ENST00000374593 CUX1P39880 1505 aa38.84■■■■□ 3.81
CTNNAL1-202ENST00000374593 FBLN2P98095 1184 aa38.8■■■■□ 3.8
CTNNAL1-202ENST00000374593 WDR97A6NE52 1622 aa38.74■■■■□ 3.79
CTNNAL1-202ENST00000374593 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.71■■■■□ 3.79
CTNNAL1-202ENST00000374593 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.69■■■■□ 3.78
CTNNAL1-202ENST00000374593 ARAP1Q96P48 1450 aa38.65■■■■□ 3.78
CTNNAL1-202ENST00000374593 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
CTNNAL1-202ENST00000374593 GRIN2BQ13224 1484 aa38.58■■■■□ 3.77
CTNNAL1-202ENST00000374593 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
CTNNAL1-202ENST00000374593 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.54■■■■□ 3.76
CTNNAL1-202ENST00000374593 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
CTNNAL1-202ENST00000374593 SYNJ2O15056 1496 aa38.47■■■■□ 3.75
CTNNAL1-202ENST00000374593 SYNJ1O43426 1573 aa38.46■■■■□ 3.75
CTNNAL1-202ENST00000374593 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.44■■■■□ 3.74
CTNNAL1-202ENST00000374593 PBRM1Q86U86 1689 aa38.43■■■■□ 3.74
CTNNAL1-202ENST00000374593 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.41■■■■□ 3.74
CTNNAL1-202ENST00000374593 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.38■■■■□ 3.73
CTNNAL1-202ENST00000374593 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
CTNNAL1-202ENST00000374593 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
CTNNAL1-202ENST00000374593 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.18■■■■□ 3.7
CTNNAL1-202ENST00000374593 TOP2BQ02880 1626 aa38.17■■■■□ 3.7
CTNNAL1-202ENST00000374593 GRIN2AQ12879 1464 aa38.09■■■■□ 3.69
CTNNAL1-202ENST00000374593 ADAMTS12P58397 1594 aa38.08■■■■□ 3.69
CTNNAL1-202ENST00000374593 NUP160Q12769 1436 aa37.99■■■■□ 3.67
CTNNAL1-202ENST00000374593 CEP170Q5SW79 1584 aa37.98■■■■□ 3.67
CTNNAL1-202ENST00000374593 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.95■■■■□ 3.67
CTNNAL1-202ENST00000374593 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.95■■■■□ 3.67
CTNNAL1-202ENST00000374593 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.92■■■■□ 3.66
CTNNAL1-202ENST00000374593 SHROOM2Q13796 1616 aa37.83■■■■□ 3.65
CTNNAL1-202ENST00000374593 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CTNNAL1-202ENST00000374593 JPH4Q96JJ6 628 aa37.56■■■■□ 3.6
CTNNAL1-202ENST00000374593 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.55■■■■□ 3.6
CTNNAL1-202ENST00000374593 IGF1RP08069 1367 aa37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms