Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ACSM1Q08AH1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms