Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms