Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms