Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms