Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC32Q9BV29 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC32Q9BV29 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms