Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC32Q9BV29 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC32Q9BV29 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC32Q9BV29 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC32Q9BV29 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC32Q9BV29 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC32Q9BV29 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC32Q9BV29 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC32Q9BV29 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC32Q9BV29 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC32Q9BV29 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC32Q9BV29 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC32Q9BV29 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC32Q9BV29 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC32Q9BV29 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC32Q9BV29 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC32Q9BV29 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC32Q9BV29 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC32Q9BV29 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC32Q9BV29 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC32Q9BV29 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC32Q9BV29 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC32Q9BV29 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC32Q9BV29 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC32Q9BV29 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC32Q9BV29 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC32Q9BV29 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC32Q9BV29 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC32Q9BV29 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC32Q9BV29 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC32Q9BV29 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC32Q9BV29 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC32Q9BV29 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC32Q9BV29 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC32Q9BV29 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC32Q9BV29 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC32Q9BV29 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC32Q9BV29 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC32Q9BV29 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC32Q9BV29 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC32Q9BV29 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC32Q9BV29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC32Q9BV29 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC32Q9BV29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC32Q9BV29 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC32Q9BV29 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC32Q9BV29 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC32Q9BV29 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC32Q9BV29 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC32Q9BV29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC32Q9BV29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC32Q9BV29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC32Q9BV29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC32Q9BV29 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC32Q9BV29 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC32Q9BV29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC32Q9BV29 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC32Q9BV29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC32Q9BV29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC32Q9BV29 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC32Q9BV29 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC32Q9BV29 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC32Q9BV29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC32Q9BV29 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC32Q9BV29 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC32Q9BV29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC32Q9BV29 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC32Q9BV29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC32Q9BV29 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC32Q9BV29 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC32Q9BV29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC32Q9BV29 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC32Q9BV29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC32Q9BV29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC32Q9BV29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC32Q9BV29 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC32Q9BV29 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC32Q9BV29 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC32Q9BV29 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC32Q9BV29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC32Q9BV29 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC32Q9BV29 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC32Q9BV29 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC32Q9BV29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC32Q9BV29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC32Q9BV29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC32Q9BV29 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC32Q9BV29 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC32Q9BV29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC32Q9BV29 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC32Q9BV29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC32Q9BV29 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC32Q9BV29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms