Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABGEF1Q9UJ41 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RABGEF1Q9UJ41 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGEF1Q9UJ41 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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