Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RABGEF1Q9UJ41 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RABGEF1Q9UJ41 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RABGEF1Q9UJ41 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RABGEF1Q9UJ41 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RABGEF1Q9UJ41 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RABGEF1Q9UJ41 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RABGEF1Q9UJ41 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RABGEF1Q9UJ41 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RABGEF1Q9UJ41 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RABGEF1Q9UJ41 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RABGEF1Q9UJ41 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RABGEF1Q9UJ41 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RABGEF1Q9UJ41 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RABGEF1Q9UJ41 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RABGEF1Q9UJ41 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RABGEF1Q9UJ41 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RABGEF1Q9UJ41 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RABGEF1Q9UJ41 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RABGEF1Q9UJ41 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RABGEF1Q9UJ41 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RABGEF1Q9UJ41 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RABGEF1Q9UJ41 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RABGEF1Q9UJ41 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGEF1Q9UJ41 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RABGEF1Q9UJ41 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RABGEF1Q9UJ41 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RABGEF1Q9UJ41 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RABGEF1Q9UJ41 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RABGEF1Q9UJ41 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RABGEF1Q9UJ41 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RABGEF1Q9UJ41 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RABGEF1Q9UJ41 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RABGEF1Q9UJ41 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RABGEF1Q9UJ41 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABGEF1Q9UJ41 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABGEF1Q9UJ41 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABGEF1Q9UJ41 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGEF1Q9UJ41 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABGEF1Q9UJ41 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RABGEF1Q9UJ41 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RABGEF1Q9UJ41 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RABGEF1Q9UJ41 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGEF1Q9UJ41 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RABGEF1Q9UJ41 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RABGEF1Q9UJ41 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RABGEF1Q9UJ41 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RABGEF1Q9UJ41 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RABGEF1Q9UJ41 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RABGEF1Q9UJ41 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RABGEF1Q9UJ41 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RABGEF1Q9UJ41 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGEF1Q9UJ41 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGEF1Q9UJ41 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RABGEF1Q9UJ41 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RABGEF1Q9UJ41 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RABGEF1Q9UJ41 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGEF1Q9UJ41 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RABGEF1Q9UJ41 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABGEF1Q9UJ41 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABGEF1Q9UJ41 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABGEF1Q9UJ41 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RABGEF1Q9UJ41 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGEF1Q9UJ41 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGEF1Q9UJ41 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABGEF1Q9UJ41 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGEF1Q9UJ41 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGEF1Q9UJ41 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RABGEF1Q9UJ41 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABGEF1Q9UJ41 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGEF1Q9UJ41 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RABGEF1Q9UJ41 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RABGEF1Q9UJ41 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABGEF1Q9UJ41 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGEF1Q9UJ41 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGEF1Q9UJ41 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGEF1Q9UJ41 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGEF1Q9UJ41 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGEF1Q9UJ41 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGEF1Q9UJ41 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGEF1Q9UJ41 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGEF1Q9UJ41 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RABGEF1Q9UJ41 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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