Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAGEC2Q9UBF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MAGEC2Q9UBF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAGEC2Q9UBF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MAGEC2Q9UBF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAGEC2Q9UBF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms