Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6BQ9NRW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6BQ9NRW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6BQ9NRW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms