Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSS2Q9NR19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS2Q9NR19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS2Q9NR19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS2Q9NR19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS2Q9NR19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms