Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ACSS2Q9NR19 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ACSS2Q9NR19 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ACSS2Q9NR19 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ACSS2Q9NR19 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ACSS2Q9NR19 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ACSS2Q9NR19 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ACSS2Q9NR19 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ACSS2Q9NR19 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ACSS2Q9NR19 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ACSS2Q9NR19 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ACSS2Q9NR19 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACSS2Q9NR19 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ACSS2Q9NR19 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ACSS2Q9NR19 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ACSS2Q9NR19 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ACSS2Q9NR19 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ACSS2Q9NR19 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ACSS2Q9NR19 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ACSS2Q9NR19 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ACSS2Q9NR19 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ACSS2Q9NR19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ACSS2Q9NR19 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACSS2Q9NR19 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ACSS2Q9NR19 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ACSS2Q9NR19 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ACSS2Q9NR19 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ACSS2Q9NR19 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACSS2Q9NR19 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ACSS2Q9NR19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACSS2Q9NR19 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ACSS2Q9NR19 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACSS2Q9NR19 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ACSS2Q9NR19 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACSS2Q9NR19 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ACSS2Q9NR19 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ACSS2Q9NR19 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACSS2Q9NR19 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACSS2Q9NR19 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ACSS2Q9NR19 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACSS2Q9NR19 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACSS2Q9NR19 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ACSS2Q9NR19 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACSS2Q9NR19 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACSS2Q9NR19 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACSS2Q9NR19 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACSS2Q9NR19 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACSS2Q9NR19 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACSS2Q9NR19 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACSS2Q9NR19 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACSS2Q9NR19 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ACSS2Q9NR19 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ACSS2Q9NR19 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACSS2Q9NR19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACSS2Q9NR19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACSS2Q9NR19 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACSS2Q9NR19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACSS2Q9NR19 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACSS2Q9NR19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACSS2Q9NR19 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACSS2Q9NR19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ACSS2Q9NR19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACSS2Q9NR19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACSS2Q9NR19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACSS2Q9NR19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACSS2Q9NR19 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACSS2Q9NR19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACSS2Q9NR19 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACSS2Q9NR19 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACSS2Q9NR19 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACSS2Q9NR19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACSS2Q9NR19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACSS2Q9NR19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACSS2Q9NR19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACSS2Q9NR19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACSS2Q9NR19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACSS2Q9NR19 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACSS2Q9NR19 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ACSS2Q9NR19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ACSS2Q9NR19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACSS2Q9NR19 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACSS2Q9NR19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACSS2Q9NR19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACSS2Q9NR19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACSS2Q9NR19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACSS2Q9NR19 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACSS2Q9NR19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACSS2Q9NR19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACSS2Q9NR19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACSS2Q9NR19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACSS2Q9NR19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms