Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDEL1Q9GZM8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDEL1Q9GZM8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDEL1Q9GZM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms