Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMBRA1Q9C0C7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMBRA1Q9C0C7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms