Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP3Q9BZ76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP3Q9BZ76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP3Q9BZ76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP3Q9BZ76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms