Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRACR2AQ9BSW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRACR2AQ9BSW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRACR2AQ9BSW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms