Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF559Q9BR84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF559Q9BR84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF559Q9BR84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms