Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCMTD1Q96MG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCMTD1Q96MG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PCMTD1Q96MG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCMTD1Q96MG8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms