Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTERF3Q96E29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTERF3Q96E29 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTERF3Q96E29 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTERF3Q96E29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTERF3Q96E29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms