Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF01

PNISR, Arginine/serine-rich protein PNISR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISRQ8TF01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PNISRQ8TF01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PNISRQ8TF01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PNISRQ8TF01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PNISRQ8TF01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PNISRQ8TF01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PNISRQ8TF01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PNISRQ8TF01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms