Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHST4Q8NCG5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHST4Q8NCG5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHST4Q8NCG5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms