Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD4Q8IYR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD4Q8IYR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD4Q8IYR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms