Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 511.09□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 34
PHF6Q8IWS0 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 510.1□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 34
PHF6Q8IWS0 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 55.01□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 34
PHF6Q8IWS0 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.46□□□□□ -1.79e-7■■■■■ 34
PHF6Q8IWS0 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.129e-7■■■■■ 34
PHF6Q8IWS0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 33.6
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-204ENST00000418005 563 ntTSL 425.89■■□□□ 1.743e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-208ENST00000464301 571 ntTSL 415.91■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-207ENST00000458054 593 ntTSL 411.11□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-203ENST00000412905 337 ntTSL 38.92□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 47.53□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 25.91□□□□□ -1.463e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 33.4
PHF6Q8IWS0 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 418.37■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 33.3
PHF6Q8IWS0 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-9■■■■■ 33.2
PHF6Q8IWS0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 320.34■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 316.68■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 315.77■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 32.9
PHF6Q8IWS0 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 315.63■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 32.8
PHF6Q8IWS0 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.43□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 32.8
PHF6Q8IWS0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 32.5
PHF6Q8IWS0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 32.5
PHF6Q8IWS0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.854e-6■■■■■ 32.4
PHF6Q8IWS0 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 329.72■■■□□ 2.354e-6■■■■■ 32.4
PHF6Q8IWS0 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 318.19■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 32.4
PHF6Q8IWS0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.376e-10■■■■■ 32.3
PHF6Q8IWS0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 32.3
PHF6Q8IWS0 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.746e-10■■■■■ 32.3
PHF6Q8IWS0 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.13□□□□□ -1.756e-10■■■■■ 32.3
PHF6Q8IWS0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 32.2
PHF6Q8IWS0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 325.47■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 225.47■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 225.47■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 322.91■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 317.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 TRAF4-210ENST00000475329 544 ntTSL 313.52□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 32.1
PHF6Q8IWS0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 31.9
PHF6Q8IWS0 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 31.6
PHF6Q8IWS0 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 216.27■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 31.6
PHF6Q8IWS0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 31.6
PHF6Q8IWS0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 31.4
PHF6Q8IWS0 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 412.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 31.4
PHF6Q8IWS0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.456e-7■■■■■ 31.4
PHF6Q8IWS0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 31.4
PHF6Q8IWS0 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 521.36■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 31.4
PHF6Q8IWS0 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 521.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 31.3
PHF6Q8IWS0 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 222.31■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 31.2
PHF6Q8IWS0 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 321.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 31.1
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 218.03■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 31.1
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 31.1
PHF6Q8IWS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.958e-7■■■■■ 31
PHF6Q8IWS0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.838e-7■■■■■ 31
PHF6Q8IWS0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 31
PHF6Q8IWS0 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 211.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 30.9
PHF6Q8IWS0 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 217.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 30.9
PHF6Q8IWS0 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 30.8
PHF6Q8IWS0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 30.8
PHF6Q8IWS0 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 224.16■■□□□ 1.468e-7■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.38□□□□□ -0.435e-32■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-32■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.17□□□□□ -1.265e-32■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.395e-32■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.935e-32■■■■■ 30.7
PHF6Q8IWS0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.542e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 524.06■■□□□ 1.442e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 323.64■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 323.64■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 LTBP4-208ENST00000593738 302 ntTSL 321.45■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 30.6
PHF6Q8IWS0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.675e-12■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.245e-12■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.215e-12■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.784e-7■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 30.5
PHF6Q8IWS0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.492e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.282e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 525.73■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 30.4
Retrieved 100 of 4,170 protein–RNA pairs in 119.2 ms