Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM46Q7Z4K8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM46Q7Z4K8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM46Q7Z4K8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms