Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP135Q66GS9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP135Q66GS9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP135Q66GS9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP135Q66GS9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP135Q66GS9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms