Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF14Q5SWL7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF14Q5SWL7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF14Q5SWL7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms