Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ODF2Q5BJF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ODF2Q5BJF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ODF2Q5BJF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ODF2Q5BJF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms