Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL12Q53G59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL12Q53G59 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL12Q53G59 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL12Q53G59 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms