Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P3H1Q32P28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
P3H1Q32P28 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P3H1Q32P28 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
P3H1Q32P28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
P3H1Q32P28 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms