Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN21Q16825 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN21Q16825 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN21Q16825 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN21Q16825 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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