Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PTPN21Q16825 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPN21Q16825 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPN21Q16825 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPN21Q16825 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPN21Q16825 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPN21Q16825 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPN21Q16825 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPN21Q16825 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPN21Q16825 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPN21Q16825 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPN21Q16825 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPN21Q16825 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPN21Q16825 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPN21Q16825 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPN21Q16825 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPN21Q16825 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPN21Q16825 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPN21Q16825 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPN21Q16825 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPN21Q16825 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPN21Q16825 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPN21Q16825 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPN21Q16825 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPN21Q16825 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPN21Q16825 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPN21Q16825 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPN21Q16825 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPN21Q16825 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPN21Q16825 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPN21Q16825 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPN21Q16825 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPN21Q16825 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN21Q16825 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN21Q16825 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPN21Q16825 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPN21Q16825 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPN21Q16825 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPN21Q16825 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPN21Q16825 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPN21Q16825 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPN21Q16825 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPN21Q16825 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPN21Q16825 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPN21Q16825 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPN21Q16825 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPN21Q16825 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPN21Q16825 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPN21Q16825 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPN21Q16825 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPN21Q16825 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPN21Q16825 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPN21Q16825 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPN21Q16825 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPN21Q16825 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPN21Q16825 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPN21Q16825 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPN21Q16825 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPN21Q16825 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPN21Q16825 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPN21Q16825 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPN21Q16825 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPN21Q16825 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPN21Q16825 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPN21Q16825 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPN21Q16825 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPN21Q16825 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPN21Q16825 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPN21Q16825 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPN21Q16825 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPN21Q16825 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPN21Q16825 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPN21Q16825 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN21Q16825 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPN21Q16825 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPN21Q16825 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPN21Q16825 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN21Q16825 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN21Q16825 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPN21Q16825 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPN21Q16825 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPN21Q16825 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPN21Q16825 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPN21Q16825 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPN21Q16825 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN21Q16825 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN21Q16825 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPN21Q16825 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPN21Q16825 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPN21Q16825 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN21Q16825 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPN21Q16825 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPN21Q16825 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPN21Q16825 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPN21Q16825 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPN21Q16825 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN21Q16825 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN21Q16825 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPN21Q16825 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
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