Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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TNXAQ16473 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNXAQ16473 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNXAQ16473 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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TNXAQ16473 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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TNXAQ16473 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TNXAQ16473 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TNXAQ16473 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNXAQ16473 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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